Prosessen med å fermentere mikroorganismer i en dyp tank kalles dyp tankgjæring. Den ble utviklet for 50 år siden av NCAUR, som senere lanserte et arsenal av antibiotika mot menneskelig sykdom. Jackson og kollegene hans forbedret teknologien ved å utvikle fermenteringsoppskrifter som var mer effektive enn tidligere oppskrifter. Deres arbeid forbedret masseproduksjonen av P. fumosoroseus-sporer. Nå ser de etter å bruke dem i felten.
For å produsere store mengder penicillin henvendte USA og Storbritannia seg til de største kjemiske og farmasøytiske selskapene i USA. Pfizer lyktes i å produsere store mengder penicillin gjennom dyp tankgjæring, og ved slutten av krigen var penicillin allment tilgjengelig for allierte soldater. I dag er dyptankgjæring den mest brukte metoden for farmasøytisk produksjon. Imidlertid er det fortsatt mange begrensninger for denne fermenteringsmetoden. Ineffektiv overflategjæring er upraktisk for høye produksjonsvolumer.
For å lage store mengder penicillin brukte Pfizer-forskere først denne aseptiske gjæringsteknikken på produksjonen av sitronsyre. Etter hvert som teknologien ble stadig mer raffinert, var det mulig å øke renheten og styrken til penicillin. Til syvende og sist viste Jasper Kanes eksperiment at dyp tankgjæring var en effektiv måte å produsere store mengder av antibiotikumet penicillin. Pfizer trengte gigantiske gjæringstanker for å kunne produsere antibiotikaen i stor skala. Heldigvis konverterte Pfizer en gammel isfabrikk i Brooklyn til en penicillinfabrikk.
Pfizers penicillinforskere hadde vanskelig for å jobbe med muggsoppen som får den til å produsere et høykvalitetsprodukt. Overflatefermenteringsmetoder er utsatt for forurensning, noe som resulterer i lave utbytter. Da Kane foreslo dyp tankgjæring, ble han møtt med en overveldende respons. Han foreslo denne metoden, men selskapet måtte ofre flere lønnsomme produkter for å gjøre den kommersielt levedyktig. Dette var et risikabelt forslag for Pfizer, og det ville kreve avvikling av andre produkter.
I laboratoriet syntetiserte forskere penicillin ved hjelp av en penicilliummugg som naturlig produserer antibiotikumet penicillin. Formen dyrkes i en dyp gjæringstank med sukker og andre ingredienser. Som et resultat produseres og gjenvinnes antibiotikaen ved slutten av gjæringen. Imidlertid er det fortsatt ikke klart om dyp tankgjæring er en bedre måte å lage antibiotika på. Imidlertid er det en nyttig teknikk for bioproduksjon av antibiotika.
Pfizers pilotanlegg ved bruk av Curries metode ble etablert i 1919. Sitronsyre produsert ved bruk av denne metoden var mye høyere enn mengden oppnådd fra sitrusfrukter. Prosessen var i utgangspunktet mislykket, men til slutt ga den høyt nok til at Pfizer begynte å bruke den på andre produkter. Denne prosessen ble utviklet i dype tanker, noe som gjorde at Pfizer kunne produsere sitronsyre mer effektivt enn noen gang. Det tok ikke lang tid før gjæringsteknologien gikk raskere enn produksjonen basert på sitrusfrukter.
